جیل الیکٹروفورسس یا تو افقی یا عمودی واقفیت میں کیا جاسکتا ہے۔ عمودی جیل عام طور پر ایکریلامائڈ میٹرکس پر مشتمل ہوتے ہیں۔ ان جیلوں کے سوراخ کے سائز کا انحصار کیمیائی اجزاء کے ارتکاز پر ہوتا ہے: ایگرز جیل کے چھید (100 سے 500 nm قطر) ایکریلامائڈ جیل پورس (10 سے 200 nm قطر) کے مقابلے بڑے اور کم یکساں ہوتے ہیں۔ تقابلی طور پر، ڈی این اے اور آر این اے کے مالیکیول پروٹین کے لکیری اسٹرینڈ سے بڑے ہوتے ہیں، جو اکثر اس عمل سے پہلے، یا اس کے دوران، ان کا تجزیہ کرنا آسان بناتے ہیں۔ اس طرح، پروٹین کو ایکریلامائیڈ جیل (عمودی طور پر) پر چلایا جاتا ہے۔ اس میں ہمارے خصوصی ڈیزائن کردہ جیل کاسٹنگ ڈیوائس کے ساتھ اصل پوزیشن میں جیل کاسٹ کرنے کا کام ہے۔
